Aunque el tiempo es tan solo un factor, puede influir mucho en tus planes de viaje, especialmente cuando planeas quedarte un período largo en Villarta de San Juan. Por lo general, los meses más cálidos son julio y agosto, con una temperatura promedio de 25 °C, mientras que los meses más fríos son enero y febrero, con un promedio de 7 °C. El promedio de precipitaciones anuales en Villarta de San Juan es de 448 mm.