Aunque el tiempo es tan solo un factor, puede influir mucho en tus planes de viaje, especialmente cuando planeas quedarte un período largo en San Juan Bautista. Por lo general, los meses más cálidos son agosto y septiembre, con una temperatura promedio de 19 °C, mientras que los meses más fríos son febrero y diciembre, con un promedio de 10 °C. El promedio de precipitaciones anuales en San Juan Bautista es de 463 mm.