Aunque el tiempo es tan solo un factor, puede influir mucho en tus planes de viaje, especialmente si planeas quedarte un período largo en Baños del Inca. Por lo general, los meses más cálidos son agosto y septiembre, con una temperatura promedio de 12 °C, mientras que los meses más fríos son julio y agosto, con un promedio de 12 °C. Los meses más lluviosos en Baños del Inca son marzo, febrero, diciembre y enero, con un promedio de precipitaciones en cada mes de 249 mm.